遠縁の生物間を比較するときに分子時計が正確でないのはなぜですか?

分子時計は、分子の進化速度が時間の経過とともに一定であるという仮定に基づいています。ただし、この仮定は、特に遠縁の生物間を比較する場合には必ずしも有効であるとは限りません。これは、分子進化の速度が、環境の変化、生物に作用する選択圧の変化、研究対象のタンパク質の構造と機能の変化など、多くの要因の影響を受ける可能性があるためです。

これらの要因の結果、分子進化の速度は生物の異なる系統間で大きく異なる可能性があります。これは、進化の速度が一定であるという仮定が有効ではないため、遠い関係にある生物間を比較する場合、分子時計が不正確になる可能性があることを意味します。

さらに、遠縁の生物間を比較する場合、分子時計の校正も課題となります。これは、化石の記録が不完全であることが多く、異なる系統の分岐に関する信頼できる年代を見つけるのが難しい場合があるためです。その結果、分子時計の校正は間接的な方法に基づいて行われることが多く、発散時間の推定にさらなる不確実性が生じる可能性があります。

これらの理由により、分子時計は、遠縁の生物間を比較する場合、必ずしも正確であるとは限りません。ただし、それでもさまざまな系統の進化の歴史に関する貴重な情報を提供することができ、他の方法が利用できない場合に分岐時間を推定するために使用できます。